Sûnt syn ûntdekking yn Djibouti yn 2012 hat de Aziatyske Anopheles stephensi-mug him ferspraat oer de Hoarn fan Afrika. Dizze invasive fektor bliuwt him oer it kontinint fersprieden, en foarmet in serieuze bedriging foar malariakontrôleprogramma's. Fektorkontrôlemetoaden, ynklusyf mei ynsektisidbehannele muggen en it spuiten fan residuen binnenshuis, hawwe de malarialêst signifikant fermindere. De tanimmende prevalinsje fan ynsektisidresistinte muggen, ynklusyf Anopheles stephensi-populaasjes, hinderet lykwols de oanhâldende malaria-eliminaasje-ynspanningen. It begripen fan populaasjestruktuer, genstream tusken populaasjes en de fersprieding fan mutaasjes yn ynsektisidresistinsje is essensjeel om effektive malariakontrôlestrategyen te begelieden.
It ferbetterjen fan ús begryp fan hoe't An. stephensi sa fêstige rekke is yn 'e HOA is krúsjaal foar it foarsizzen fan syn potinsjele fersprieding nei nije gebieten. Populaasjegenetika is wiidweidich brûkt om fektorsoarten te bestudearjen om ynsjoch te krijen yn populaasjestruktuer, oanhâldende seleksje en genstream18,19. Foar An. stephensi kin it bestudearjen fan populaasjestruktuer en genoomstruktuer helpe om syn ynvaazjerûte en elke adaptive evolúsje dy't sûnt syn ûntstean plakfûn hat, te ferdúdlikjen. Neist genstream is seleksje benammen wichtich, om't it allelen kin identifisearje dy't ferbûn binne mei ynsektizidresistinsje en ljocht kin skine op hoe't dizze allelen har troch de populaasje ferspriede20.
Oant no ta is it testen fan markers foar ynsektisidenresistinsje en populaasjegenetika yn 'e invasive soarte Anopheles stephensi beheind ta in pear kandidaatgenen. It ûntstean fan 'e soarte yn Afrika is net folslein begrepen, mar ien hypoteze is dat it yntrodusearre is troch minsken of fee. Oare teoryen omfetsje migraasje oer lange ôfstannen troch de wyn. De Etiopyske isolaten dy't yn dizze stúdzje brûkt waarden, waarden sammele yn Awash Sebat Kilo, in stêd 200 km eastlik fan Addis Abeba en oan 'e wichtichste ferfierkorridor fan Addis Abeba nei Djibouti. Awash Sebat Kilo is in gebiet mei hege malaria-oerdracht en hat in grutte populaasje fan Anopheles stephensi, dy't rapportearre wurdt resistint te wêzen foar ynsektisiden, wêrtroch it in wichtige lokaasje is foar it bestudearjen fan 'e populaasjegenetika fan Anopheles stephensi8.
De ynsektizidresistinsjemutaasje kdr L1014F waard mei lege frekwinsje ûntdutsen yn 'e Etiopyske befolking en waard net ûntdutsen yn 'e Yndiaanske fjildmonsters. Dizze kdr-mutaasje jout resistinsje tsjin pyrethroïden en DDT en waard earder ûntdutsen yn An. stephensi-populaasjes sammele yn Yndia yn 2016 en Afganistan yn 2018.31,32 Nettsjinsteande bewiis fan wiidfersprate pyrethroïderesistinsje yn beide stêden, waard de kdr L1014F-mutaasje net ûntdutsen yn 'e Mangalore- en Bangalore-populaasjes dy't hjir analysearre binne. It lege oanpart Etiopyske isolaten dy't dizze SNP drage en heterozygoot wiene, suggerearret dat de mutaasje koartlyn yn dizze populaasje ûntstien is. Dit wurdt stipe troch in eardere stúdzje yn Awash dy't gjin bewiis fûn fan 'e kdr-mutaasje yn samples dy't sammele binne yn it jier foarôfgeand oan dyjingen dy't hjir analysearre binne.18 Wy hawwe dizze kdr L1014F-mutaasje earder identifisearre mei lege frekwinsje yn in set samples út deselde regio/jier mei in amplikon-deteksje-oanpak.28 Mei it each op 'e fenotypyske wjerstân op 'e samplingplakken, suggerearret de lege allelfrekwinsje fan dizze wjerstânsmarker dat oare meganismen as modifikaasje fan it doelplak ferantwurdlik binne foar dit waarnommen fenotype.
In beheining fan dizze stúdzje is it gebrek oan fenotypyske gegevens oer de ynsektizidrespons. Fierdere stúdzjes dy't folsleine genoomsekwinsjearring (WGS) of rjochte amplikonsekwinsjearring kombinearje yn kombinaasje mei gefoelichheidsbioassays binne nedich om de ynfloed fan dizze mutaasjes op 'e ynsektizidrespons te ûndersykjen. Dizze nije missense SNP's dy't mooglik assosjeare wurde mei resistinsje moatte rjochte wurde op hege-trochput molekulêre assays om monitoring te stypjen en funksjoneel wurk te fasilitearjen om potinsjele meganismen te begripen en te falidearjen dy't ferbûn binne mei resistinsjefenotypen.
Gearfetsjend jout dizze stúdzje in djipper begryp fan 'e genetika fan 'e Anopheles-muggenpopulaasje oer ferskate kontininten. Tapassing fan folsleine genoomsekwinsjearring (WGS)-analyze op gruttere kohorten fan samples yn ferskate geografyske regio's sil essensjeel wêze foar it begripen fan genstream en it identifisearjen fan markers fan ynsektizidresistinsje. Dizze kennis sil folkssûnensautoriteiten yn steat stelle om ynformearre karren te meitsjen yn fektorbewaking en ynsektizidgebrûk.
Wy hawwe twa oanpakken brûkt om fariaasje yn kopynûmer yn dizze dataset te detektearjen. Earst hawwe wy in dekkingsbasearre oanpak brûkt dy't him rjochte op identifisearre CYP-genklusters yn it genoom (Oanfoljende Tabel S5). De stekproefdekking waard gemiddeld oer sammellokaasjes en ferdield yn fjouwer groepen: Etioopje, Yndiaanske fjilden, Yndiaanske koloanjes en Pakistaanske koloanjes. De dekking foar elke groep waard normalisearre mei kernel smoothing en doe plotte neffens de mediane genoomdekkingsdjipte foar dy groep.
Pleatsingstiid: 23 juny 2025